Aussi curieux que cela puisse paraitre pour le principal compositeur espagnol du siècle dernier, la plupart des oeuvres populaires de Manuel de Falla seront écrites pendant ses années parisiennes. Après son retour à Grenade, où il s'installe en 1921, de Falla continue à composer mais à part Le Retable de Maître Pierre, son opéra miniature de 1922 puis, un peu plus tard, le Concerto pour clavecin et cinq instruments (1923-1926), il n'entreprend plus de grand projet.
Au début des années 30, la Deuxième République est proclamée en Espagne. Catholique fervent, de Falla s'en détache vite à cause des violences que multiplient les milices socialistes contre les églises et les couvents. Sous la pression de l'extrême-gauche incarnée par les anarchistes de la CNT, le Parti Communiste ou le PSOE de Francisco Largo Caballero, le pays glisse lentement vers la guerre civile. Quand celle-ci éclate en 1936, de Falla se retrouve tiraillé entre deux fidélités. D'un côté, il dénonce vigoureusement les crimes commis par les "Républicains" qui, dès le début du conflit, organisent le massacre de plusieurs communautés de religieux. De l'autre, il tente de s'opposer à l'exécution de son ami le poète Federico Garcia Lorca, capturé puis condamné à mort par les nationalistes. De Falla ne leur pardonnera jamais ce geste et, en 1938, il se dérobe à l'invitation faite par les franquistes qui souhaitent lui offrir a présidence de l'Instituto de España. Qua d la guerre civile prend fin, il quitte l'Espagne pour l'Argentine. Il ne remettra jamais les pieds dans son pays. Manuel de Falla s'éteint à Alta Gracia le 14 novembre 1946.
On peut considérer L'Atlantide comme son testament. Commencée en 1927, l'opéra reste inachevé. C'est Ernesto Hallfter (1905-1989), son élève et ami, qui complétera la partition dont la première sera donnée en 1962.